Флаг муниципального образования сельское поселение "Нижнеключевское" утвержден решением Совета сельского поселения "Нижнеключевское" от 31 октября 2019 года № 160 и внесен в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под № 12707. Описание флага:

"Прямоугольное двухстороннее полотнище зеленого цвета с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры герба сельского поселения "Нижнеключевское", выполненные в желтом, синем и белом цвете. Обратная сторона полотнища зеркально воспроизводит лицевую".

Обоснование символики флага сельского поселения "Нижнеключевское".
Флаг сельского поселения "Нижнеключевское" составлен на основе герба сельского поселения "Нижнеключевское".
Сельское поселение Нижнеключевское" расположено на юго-востоке Нерчинского района, входит в его состав и включает село Нижние Ключи, которое расположено в пади Ключевая на левом берегу реки Шилки, в 24 км от города Нерчинска вблизи железнодорожной магистрали, поезда по которой начали движение в 1902 году. Свое название село получило из-за природных ключей, бьющих в пади из-под земли. В 1937 году село Нижнеключевское было переименовано в село Нижние Ключи.
Колесо символизирует основы экономического развития поселения, начало которому дало железная дорога. Село было основано в начале 18 в. на месте стоянки эвенков. Жителями села стали ссыльнопоселенцы Нерчинской каторги, которые распахивали земли, растили хлеб, строили дома и вместе с каторжанами и ссыльными строили, проходящий через них Транссиб, называемый в народе "Колесухой". Двенадцать золотых спиц колеса - годовой цикл природы и урожая, символ вечного движения и перспективы развития поселения.
Низ флага с чередующимся серебром и лазурью (геральдическое обозначение беличьего меха) символизирует многочисленные ключи, показывая аллегорически название села Нижние Ключи и самого поселения. Волнистый край оконечности символизирует волны великой судоходной реки Шилки, которая питается своими притоками и ключами, стекающими через село Нижние Ключи в ее воды.
Беличья оконечность символизирует природные богатства региона, славящиеся мехами.
Зеленый цвет - символ природных ресурсов поселения, окружающих его лесостепей, падей, восточной стороны склона сопки, поросшей красивым березовым лесом, а также полей и пашен, возделываемых крестьянским трудом.
Зеленый цвет символизирует весну, здоровье, природу, молодость и надежду.
Желтый (золото) - символ высшей ценности жизни, богатства, плодородия, стабильности.
Белый (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения.
Синий (лазоревый) цвет - символ чести, славы, преданности, истины и добродетели
В гербе Нижнеключевского поселения языком геральдических символов гармонично отражены история, природные особенности и богатства, а также основной профиль деятельности местного населения.
Авторская группа:
идея флага: Константин Моченов (Химки), Михаил Медведев (Санкт-Петербург);
художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва);
обоснование символики: Ирина Куренная (Чита).

Использованы материалы сайта Союза геральдистов России. Текст документа прислан В. Пермяковым