Город Новочебоксарск как отдельный город образован в 1965 году. Поначалу это был поселок-спутник Чебоксар.

Флаг Новочебоксарска утверждён Решением Новочебоксарского городского Собрания депутатов Чувашской Республики № С 52-1 от 9 февраля 2005 года по проекту В.А.Шипунова. Герб внесён в Государственный геральдический регистр под №1800.

"Прямоугольное полотнище желтого цвета с отношением высоты к длине 2:3. К верхним углам прилегают два поля синего цвета в форме прямоугольных треугольников, катетами которых являются стороны полотнища (длина катетов: по верхней грани полотнища- 1/2 длины полотнища, по боковым граням полотнища- 2/3 высоты полотнища). К нижней грани полотнища прилегает поле зеленого цвета в форме равнобедренного треугольника, основанием которого является грань полотнища, стороны параллельны гипотенузам полей синего цвета, вершина располагается на вертикальной оси полотнища, а высота составляет 1/3 высоты полотнища. На желтой части полотнища - три синих летящих к древку утки, держащих в клювах зеленые дубовые ветви: одна в центре и две ниже нее, приближенные к нижним углам полотнища".

Флаг внесён в Государственный геральдический регистр под №1800.

Информация и рисунок присланы "Вексиллографии" В. и Г. Шипуновыми