Флаг Новомалыклинского сельского поселения утверждён Решением Совета депутатов МО "Новомалыклинское СП" от 11 августа 2014 года №14/40. Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 9972. Согласно тексту Положения о флаге:

Описание и обоснование символики флага Новомалыклинского сельского поселения
2.1. Описание флага Новомалыклинского сельского поселения:
«Прямоугольное двухстороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, составленное из двух равных вертикальных полос желтого и белого цвета. Полосы по внешнему краю имеют кайму шириной 1/9 ширины полотнища, при этом белая полоса имеет кайму желтого цвета, желтая полоса - белого цвета. В центре полотнища изображены фигуры из герба Новомалыклинского сельского поселения: красное солнце, на диске которого изображен желтый сноп».
2.2. Рисунок флага Новомалыклинского сельского поселения приводится в приложении 1 к настоящему Положению, являющемся неотъемлемой частью настоящего Положения.
2.3. Обоснование символики флага Новомалыклинского сельского поселения.
Административным центром Новомалыклинского района (самого восточного района Ульяновской области) является село Новая Малыкла, которое одновременно является административным центром и сельского поселения.
За основу флага поселения принят флаг района с добавлением в нее каймы переменных цветов. Кайма - символ родства и подчиненности, и потому в гербе поселения кайма несет символику единства двух муниципальных образований.
Символика герба Новомалыклинского поселения многозначна:
- солнце - символ тепла и света, символ жизни и ее процветания, символ энергии, благодаря которой существует планета Земля. Солнце - аллегорическая фигура, указывающая на то, что жители поселения встречают новый день одними из первых в Ульяновской области;
- сноп символизирует сельскохозяйственную направленность труда жителей поселения, выращивающих богатые урожаи зерновых культур. Сноп - символ единения, процветания, преобразования.
Красный цвет (червлень) - символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника.
Желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая.
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения.
2.8. Авторская группа.
Идея: Константин Моченов (Химки).
Художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва).
Обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки).

Источник - сообщение В. Пермякова