Флаг Новошешминского района утвержден решением Совета Новошешминского муниципального района № 6-48 от 18 февраля 2006 года, внесен в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под № 2269 и в Государственный геральдический реестр Республики Татарстан под № 41. Согласно тексту Положения о флаге:

"3.1. Описание флага Новошешминского муниципального района:
"Флаг Новошешминского района представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, разделённое по горизонтали на три полосы: красную с белым горизонтальным изображением меча, белую в виде зубчатой стены с кладкой и голубую – с белым изображением щуки. Соотношения ширины красной полосы (без выступов), участка с зубчатыми выступами, белой полосы (без выступов) и голубой полосы – 33:5:25:27".
3.2. Обоснование символики флага Новошешминского муниципального района.
Флаг района разработан на основе герба.
Первое поселение в Новошешминске появилось в 1610 году. Здесь же для защиты Закамья от кочевых народов в 1652 году была построена военная крепость, вокруг которой со временем появлялись слободы (Петропавловская, Екатерининская, Архангельская и др.). Население этих слобод составляли служилые люди, не только обрабатывающие землю, но и стоявшие на охране государственной границы. В последствии они составили особое сословие «пахотных солдат». Этот период в истории Новошешминского района отражён в гербе крепостной стеной и мечом. Дополняет воинскую символику района изображение щуки – символа осторожности, бдительности и охраны.
Также щука напоминает о богатстве реки Шешмы и озёр (голубое поле) располагающихся на территории района, позволивших жителям активно заниматься рыбным промыслом.
Серебро – символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Красный цвет – символ мужества, силы, труда, красоты.
Синий, голубой цвет – символ чести, благородства, духовности
3.3. Авторская группа:
Разработка флага произведена Геральдическим советом при Президенте Республики Татарстан совместно с Союзом геральдистов России в составе:
Рамиль Хайрутдинов (Казань), Радик Салихов (Казань), Ильнур Миннуллин (Казань), Константин Мочёнов (Химки), Кирилл Переходенко (Конаково), Оксана Афанасьева (Москва).

По материалам сайта "Территориальная геральдика Республики Татарстан"