Флаг Нововаршавского района принят Решением Совета Нововаршавского муниципального района от 30 августа 2007 года №169 (в редакции решения от 27 декабря 2007 №265). Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №3729. Согласно тексту Положения о флаге:

"2. Описание флага Нововаршавского района.
2.1. Прямоугольное полотнище, воспроизводящее Герб Нововаршавского муниципального района в желтом, синем и зеленом цветах.
2.2. Геральдическое описание и обоснование символики флага Нововаршавского района приведены в приложении № 1 к настоящему Положению.
Графическое изображение флага Нововаршавского района в многоцветном варианте приведено в приложении № 2 к настоящему Положению".

По материалам раздела Нововаршавского района на "Омском портале" (сообщение Б.Вольфова)