В 1929 году образован Новозыбковский район. В 2006 году Новозыбковский район получил статус муниципального района. В 2019 году городской округ "Город Новозыбков" и Новозыбковский район были объединены в новое муниципальное образование - "Новозыбковский городской округ". Но как административно-территориальная единица Новозыбковский район продолжает существовать.

Флаг Новозыбковского района утверждён Решением Новозыбковского районного Совета народных депутатов от 28 сентября 2010 года № 11\15, Решением районного Совета народных депутатов от 17 февраля 2011 года № 16/15 утверждено "Положение об официальных символах Новозыбковского района и о порядке их официального использования". Описание флага Новозыбковского района:

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее их двух равновеликих вертикальных полос зеленого (у древка) и голубого цветов, в центре которого восемь хлебных колосьев желтого цвета, сложенные звездой"

Автор флага: Ригерт М.Г

Использованы материалы сайта администрации Новозыбковского района

С утратой районом статуса муниципального образования в 2019 году герб также утратил официальный статус.