Пожарский район получил название в память о Герое Советского Союза Иване Алексеевиче Пожарском, погибшем во время боев с японцами у озера Хасан в 1938 году. Район образован в 1939 году. Одновременно село Тихоновка было переименовано в Пожарское и стало центром района. В 1963-1965 годах территория района входила в состав Иманского сельского района. А в июне 1968 года ВС СССР решил восстановить Пожарский район, но его центром стал поселок Лучегорск. Осенью 1970 года органы местного управления были переведены в Лучегорск. В 2004-2022 годах существовало муниципальное образование Пожарский муниципальный район, затем - муниципальный округ.

Положение о флаге Пожарского района утверждено решением Думы Пожарского муниципального района от 15 декабря 2006 года (№348 "Об утверждении Положений о флаге и гимне - официальных символах Пожарского муниципального района").

"Полотнище флага Пожарского муниципального района выполнено с использованием геральдических цветов, которые обозначают:
- зеленый (зелень) - цвет надежды, радости, изобилия, благополучия: символизирует уникальную флору и фауну района;
- красный (червлень) - цвет мужества, любви, храбрости; символизирует историческую роль первостроителей, основателей Лучегорска, энергию, которой обеспечивает район более половины населения Приморского края;
-синий (лазурь) - цвет величия, верности, доверия, безупречности: символизирует водные ресурсы района, его уникальную минеральную воду "Ласточка", чистоту вод заповедной реки Бикин, чистое небо и чистые помыслы жителей района".

По материалам сайта администрации Приморского края

Новый флаг Пожарского района утвержден решением Думы Пожарского муниципального района от 28 января 2009 года №234-НПА и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №4717. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух равновеликих вертикальных полос: голубой и красной; посередине полотнища изображены фигуры герба Пожарского муниципального района: желтое кольцо из языков пламени и его центре черная ласточка с белой грудкой".

Обоснование символики флага Пожарского муниципального района.
Флаг разработан на основе герба, который языком символов и аллегорий отражает природные, географические и экономические особенности Пожарского района.
Крупнейшее предприятие района, расположенное в райцентре, посёлке Лучегорск - ЗАО "Лучегорский топливно-энергетический комплекс". Предприятие обеспечивает энергией более половины населения Приморского края. На флаге энергия добытая местными тружениками отражена пламенеющими солнечными лучами. Символику энергетической отрасли хозяйства дополняет красный цвет - символ силы, труда, мужества, красоты, мощи.
Голубой цвет и летящая ласточка отражают уникальную природу Пожарского района, его водные ресурсы, полезную минеральную воду "Ласточка", чистоту вод заповедной реки Бикин, бескрайнее голубое небо.
Летящая птица - символ полета, возвышенных устремлений, движения вперед и чистоты помыслов.
Деление полотнища на две части аллегорически показывает государственную границу с Китайской Народной Республикой, проходящую по западному краю района.
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Желтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения, интеллекта.
Черный цвет - символ мудрости и скромности.
Авторская группа:
идея флага: творческая группа депутатов Думы и работников администрации Пожарского муниципального района, Константин Моченов (Химки);
художник и компьютерный дизайн: Галина Русанова (Москва);
обоснование символики: Кирилл Переходенко (Конаково)".

По материалам сайта Союза геральдистов России

В 2022 году Пожарский муниципальный район преобразован в Пожарский муниципальный округ, при этом все входящие в муниципальный район городские и сельские поселения утратили статус муниципальных образований. Как административно-территориальная единица Пожарский район сохранился.