Поселок Селенгинск возник в 1961 году как всесоюзная комсомольская стройка Селенгинского целлюлозно-картонного комбината.

Флаг городского поселения "Селенгинское" приведен на сайте Селенгинской Детской модельной библиотеки. Стилизованная ель, видимо, символизирует градообразующее предприятие - Селенгинский целлюлозно-картонный комбинат.