Флаг сельского поселения Cенное утвержден решением XXXIX сессии Совета Сенного сельского поселения Темрюкского района I созыва от 13 марта 2008 года №180 и внесены в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под №4566. Описание флага:

"Флаг поселения представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, разделённое на три части(изогнутые полосы),две голубых и между ними желтую; посередине полотнища на желтой полосе изображение гроздей винограда".

Обоснование символики герба сельского поселения Сенное.
Появление в 1794 году почтовой станции Сенная связано с организацией и устройством Черноморских казаков в сорока куренных поселениях. Сенная стала одной многочисленных почтовых станций обеспечивающих связь не только внутри черноморского войска, но и с остальной страной. Поселок Сенной долгое время продолжал служить основной перевалочной станцией между Темрюком и Таманью. Природная среда обусловлена расположением Сенного на перешейке между Таманским заливом и Ахтанизовским лиманом. Волнистые синие края герба символизируют берега, изрезанные бухточками, заливами, песчаными косами.
Гроздья винограда -символ плодородия и изобилия, гостеприимства и щедрости; в гербе поселения также символизируют виноградарство и виноделие ставшее основой экономического развития сельского поселения. В настоящее время крупнейшим многоотраслевым хозяйством является агрофирма "Фанагория", занимающаяся производством и переработкой винограда. Символику винограда дополняет золото герба -символ урожая, стабильности, богатства, солнечного тепла, энергии жизни.
Зеленый цвет- символ природы, здоровья, молодости, жизненного опыта.
Пурпур- символ благородства, достоинства, власти.
Голубой цвет- символ чести, благородства, духовности, возвышенных устремлений, а также цвет чистого, бескрайнего неба, и морских просторов.
Авторская группа:
идея герба: Константин Моченов (Химки), Оксана Фефелова (Балашиха);
художник и компьютерный дизайн: Оксана Фефелова (Балашиха);
обоснование символики: Кирилл Переходенко (Конаково)".

По материалам сайта Союза геральдистов России