В 2017 году Шатурский муниципальный район преобразован в городской округ Шатура. Все муниципальные образования в составе бывшего района упразднены. Район перестал существовать и как административно-территориальная единица, став "городом областного подчинения Шатура с административной территорией". В 2020 году в состав городского округа Шатура вошел бывший городской округ Рошаль.

Флаг Шатурского района разработан авторским коллективом Союза геральдистов России и утверждён Решением Совета депутатов Шатурского района Московской области от 17 апреля 2003 года №8/39 "О флаге муниципального образования "Шатурский район". Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №1185. Официальное описание флага:

"Флаг Шатурского района представляет собой зелёное прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее смещённые к древку жёлтые фигуры из гербовой композиции: летящего с воздетыми крыльями журавля и выходящее в левом углу от древка солнце. Вдоль нижнего края полотнища синяя полоса в 1/6 ширины полотнища, отделённая от зелёной узкой жёлтой полосой в 1/40 ширины полотнища".

Обоснование символики флага:

За основу композиции флага Шатурского района взято его особенное географическое расположение на территории Московской области — это самый восточный приграничный район области. Во все фигуры флага заложена многозначная символика.
Журавль — символ бдительности и преданности, олицетворяет жизненную силу, абсолютный дух и чистое сознание, передаёт изумительную по красоте природу Шатурского края.
Кроме того, журавль, взмывающий в небо, означает стремление к совершенству, в будущее.
Восходящее солнце — символ созидательной силы, аллегорически говорит о том, что жители Шатурского района первыми в Московской области встречают восход солнца, а значит, и наступление нового дня. Возникающее солнце — символ творящего первоначала, являясь источником тепла, мира и согласия, изливает на землю поток жизнетворных сил, а на людей — свою благодать. Люди солнца — мудрые, верные, надёжные друзья.
Жёлтый цвет (золото) — символ прочности, богатства, величия, интеллекта и прозрения.
Синяя часть полотнища аллегорически показывает, что в районе насчитывается около 300 озёр.
Синий цвет (лазурь) — символ чести, славы, преданности, истины, красоты, добродетели и чистого неба.
Зелёная часть полотнища дополняет символику флага и означает достаток, процветание, стабильность".

Материалы справочной правовой системы "Гарант"

В решение о флаге (2003) вносены изменения Решением Совета депутатов Шатурского МР от 25 апреля 2012 года № 15/31 [добавлен пункт о том, что устанавливается флаг района как официальный символ], в тот же день принято новое Положение о флаге Решением Совета депутатов Шатурского МР от 25 апреля 2012 года № 16/31 "Об утверждении Положения о флаге Шатурского муниципального района Московской области". Сам флаг при этом не менялся.

Тексты документов присланы В. Марковым

Флаг Шатурского муниципального района внесён в Геральдический регистр Московской области под № II-0117.

После преобразования Шатурского муниципального района в городской округ Шатура (2017) символами городского округа стали бывшие символы Шатурского муниципального района. Городское поселение Шатура утратило муниципальный статус и право использовать собственные символы.

В 2020 году городские округа Шатура и Рошаль были объединены, новое муниципальное образование сохранило наименование "городской округ Шатура". Флаг городского округа Шатура утвержден решением Совета депутатов Городского округа Шатура от 28 июля 2022 года № 7/37. На флаге округа добавилось изображение волн внизу полотнища. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под №14015. Описание флага Городского округа Шатура:

"Прямоугольное зеленое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее изображение фигур из герба Городского округа Шатура, выполненных синим, и желтым цветами. Обратная сторона полотнища зеркально воспроизводит лицевую".

Обоснование символики флага Городского округа Шатура.
В соответствии с Законом Московской области от 30.04.2020 №80/2020-ОЗ "О преобразовании городского округа Шатура Московской области и городского округа Рошаль Московской области, о статусе и установлении границы вновь образованного муниципального образования" городской округ Шатура Московской области (ранее - Шатурский муниципальный район) и городской округ Рошаль были объединены и преобразованы во вновь образованный Городской округ Шатура («Большая Шатура» – устоявшееся в обиходе неофициальное название). Образование нового (объединенного) муниципального образования вызвало необходимость создания новой официальной символики для Городского округа Шатура.
Выражая преемственность существующей муниципальной официальной символики, за основу композиции флага Городского округа Шатура взят флаг Шатурского муниципальною района, утверждённый решением Совета депутатов Шатурского района от 17.04.2003 №8/39 (затем утвержденный Советом депутатов городского округа Шатура Московской области от 29.11.2017 № 6/45).
В основу флага Городского округа Шатура легло особенное географическое расположение Городского округа Шатура на территории Московской области – это самая восточная приграничная территория области. Во все фигуры флага заложена многозначная символика.
Журавль – символ бдительности и преданности, олицетворяет жизненную силу, абсолютный дух и чистое сознание, передает изумительную по красоте природу Шатурского края. Кроме того, журавль, взмывающий в небо, означает стремление к совершенству, в будущее.
Восходящее солнце – символ созидательной силы, аллегорически говорит о том, что жители Городского округа Шатура первыми в Московской области встречают восход солнца, а значит – и наступление нового дня. Возникающее солнце – символ творящего первоначала, являясь источником тепла, мира и согласия, изливает на землю поток жизнетворческих сил, а на людей – свою благодать. Люди солнца – мудрые, верные, надежные друзья.
Синяя, с золотыми волнами, оконечность аллегорически показывает, что в Городском округе Шатура насчитывается несколько сотен озёр.
Примененные во флаге цвета символизируют:
желтый цвет – символ прочности, богатства, величия, интеллекта и прозрения;
синий цвет – символ чести, славы, преданности, истины, красоты, добродетели и чистого неба;
зелёный – цвет природы, дополняет символику герба и означает достаток, процветание, стабильность.
Авторская группа:
идея флага: Алексей Артюхин, Константин Елихов (г. Шатура), Константин Моченов (г. Химки), Алла Кирстя (г. Шатура);
обоснование символики: Галина Туник (г. Москва);
компьютерный дизайн: Ольга Салова (г. Москва).

По информации К.Ф. Моченова