Флаг Слюдянского района разработан творческой группой Союза геральдистов России, утвержден Решением Слюдянской районной Думы № 10 IV-рд от 26 февраля 2009 года и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 4832.

Флаг представляет собой "прямоугольное красное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее посередине голубой круг с белыми узорами в окружении белых (с серыми тенями) кристаллов".

Обоснование символики флага Слюдянского района.
Административный центр Слюдянского района — город Слюдянка, который развился из станции Слюдянка, открытой в 1905 г. на трассе Транссибирской железнодорожной магистрали. Название станции связано с именем протекающей неподалеку речки Слюдянки, имя которой напрямую связано с добычей слюды (флогопита) на южном побережье озера Байкала, которое ведётся с XVIII века.
Флаг Слюдянского района представляет собой композицию двух аллегорий: шар — озеро Байкал и кольцо — кристаллы слюды. Голубой круг (шар) символизирует знаменитое своей чистейшей водой «славное море — священный Байкал» (круг дополнен серебряными завитками внутри круга — аллегория гребней волн озера). Круг заключен в кольцо стилизованное под кристаллы слюды, гласно указывающее название района. Символика кольца — неразрывное единство, цельность, бесконечный круговорот.
Красный цвет — символ труда, красоты, праздника, мужества, жизнеутверждающей силы.
Голубой цвет — символ возвышенных устремлений, чести, славы, преданности, бессмертия.
Белый цвет (серебро) — символ ясности, открытости, примирения.
Авторская группа:
— идея флага: Галина Русанова (Москва), Константин Моченов (Химки);
— художник и компьютерный дизайн: Галина Русанова (Москва);
— обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки).

Текст документа предоставлен В. Пермяковым