Флаг муниципального образования утверждён решением Совета Смоленского сельского поселения от 28 января 2011 года №91 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 6801. Описание флага:
"Прямоугольное малиновое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба поселения в белом, черном голубом и желтом цвете".
Обоснование символики флага Смоленского сельского поселения.
Флаг разработан на основе герба Смоленского сельского поселения.
Центр сельского поселения - станица Смоленская основана казаками-переселенцами в 1864 году на берегу реки Афипс. Свое название станица получила по Смоленскому полку, участвовавшему в Кавказской войне и квартировавшему здесь.
Изображенная на флаге пушка с райской птицей символизируют не только роль военных в основании населенных пунктов муниципального образования, но и перекликаясь со смоленским гербом указывают на историю возникновения названия сельского поселения.
Изображение крепостной стены с волнистым краем и голубой каймой символизирует первоначально проходившую границу и линию обороны по берегу реки Афипс.
Малиновый (пурпурный) цвет поля символизирует ключевую роль казачества в освоении и обустройстве здешних территорий.
Пурпур - определяющий цвет запорожского, черноморского, а затем и кубанского казачества, в том числе казаков, переселившихся из казачьих станиц и основавших станицу Смоленскую. Пурпур - цвет достоинства, славы, почета и величия.
Черный цвет - символ плодородия, мудрости, благоразумия, вечности бытия.
Желтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения; цвет спелых нив.
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Авторская группа:
идея флага: Николай Ищенко (ст. Дядьковское), Анатолий Раков (Краснодар), Константин Моченов (Химки);
художники: Николай Ищенко (ст. Дядьковское), Ирина Соколова (Москва);
компьютерный дизайн: Ирина Соколова (Москва);
обоснование символики: Николай Ищенко (ст. Дядьковское), Кирилл Переходенко (Конаково)".
Использованы материалы сайта Союза геральдистов России и документы правовой базы Министерства юстиции.