Центр поселения - село Средняя Якушка, на территории СП также расположены сёла Нижняя Якушка, Верхняя Якушка, Старая Малыкла.

Флаг Среднеякушкинского сельского поселения утвержден Решением Совета депутатов Среднеякушкинского от 29 июля 2013 года №54/36 (рисунок флага дан в приложении).

"2.1. Описание флага Среднеякушкинского сельского поселения:
"Прямоугольное двухстороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры герба Среднеякушкинского сельского поселения в желтом и пурпурном цвете".
2.2. Рисунок флага Среднеякушкинского сельского поселения приводится в приложении 1, являющемся неотъемлемой частью настоящего Положения.
2.3. Обоснование символики флага Среднеякушкинского сельского поселения.
Флаг разработан на основе герба Среднеякушкинского сельского поселения:
Первые жители – чуваши - поселились в районе разъезда «Обамза» приблизительно в начале XVIII века. Появление калмыков на этой территории, вследствие крестьянской войны под предводительством Пугачева, согнало первых поселенцев в лес в Юртыш - это небольшой остров, окруж?нный оз?рами и болотами. Оттуда люди выезжали на обработку земли в районы Средней и Верхней Якушки. В 1743 году посёлок Якушкино был нанесен на карту. Население чуваш росло, оно разделилось на три группы. Первые две ушли на юго-восток и организовали селения Средняя и Верхняя Якушки, а третья группа осталась на месте Нижней Якушки. Жители сёл Нижняя и Средняя Якушки обрабатывали вместе землю. Флаг Среднеякушкинского сельского поселения отражает его исторические и культурные особенности:
Границы ступенчатого ромба, рассеченного на пурпурные и золотые поля, символизирует развитие Среднеякушкинского сельского посления. Так же край ромба схож с географической границей, нанесенной на карту середины XVIII века при межевании Симбирской губернии. Восьмилучевая везда – элемент традиционного чувашского орнамента. Пять звезд на флаге аллегорически символизирует пять населенных пунктов, входящих в состав Среднеякушкинского сельского поселения: село Средняя Якушка, село Верхняя Якушка, село Нижняя Якушка, разъезд Обамза, село Старая Малыкла;
- желтый цвет (золото) – традиционный чувашский цвет - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая.
- пурпур (малиновый цвет) – традиционный чувашский цвет - символ власти, славы, почета, благородства происхождения, древности.
2.7 Авторская группа:
идея герба: Константин Моченов (Химки);
художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва);
обоснование символики: Ефимовский Константин (Архангельcк)".

Источник - сайт Среднеякушкинского СП

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №8707.