Флаг района утвержден Решением № 146 Собрания депутатов Струго-Красненского района от 23 декабря 2008 года.

Описание флага Струго-Красненского района:
Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию гербового щита: щит волнисто четверочастный, первая и четвёртая части – червлёные (красные), вторая и третья – серебряные; поверх всего две ладьи (струги) с носовыми украшениями в виде конских голов одна над другой с переменой цвета.

Обоснование символики флага Струго-Красненского района:
струги являются основными фигурами и говорят о названии посёлка Струги Красные, центра Струго-Красненского района, который до 1919 года имел название Струги-Белая;
волнистое деление щита отражает также второе смысловое значение слова "струг" - ручеек, маленькое озеро;
серебро в геральдике символизирует чистоту, мудрость, благородство, мир, взаимосотрудничество;
красный цвет – символ мужества, красоты и жизни.

Авторская группа:
Авторы флага: Борис Хохлов (п. Струги Красные), Константин Моченов (г. Химки);
Художник: Роберт Маланичев (г. Москва);
Компьютерный дизайн: Сергей Исаев (г. Москва).

По информации Фалько Шмидта

Решением Собрания депутатов Струго-Красненского района № 117 от 25 июня 2020 года в Положение о флаге внесены изменения: описание флага изложено в новой редакции ("серебро" везде по тексту заменено на "белый цвет"):

"3.1. Описание флага Струго-Красненского района:
прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Струго-Красненского района: полотнище волнисто начетверо разбито на красные и белые части, в центре полотнища изображены одна под другой две ладьи (струги), переменных цветов, с носовыми украшениями в виде конских голов"

Текст документа прислан В. Пермяковым

В 2021 году флаг Струго-Красненского района внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 13483.