Флаг и эмблема района установлены Решением районного Совета от 22 февраля 2007 года № 5. Описание флага:

"Флаг района представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к его длине - 2:3. Верхняя часть белого цвета составляет 3/8 ширины флага и олицетворяет название района - Свободненский («свобода» традиционно представляется во флаговой геральдике белым цветом). Нижняя часть синего (голубого) цвета размером 3/8 ширины флага с двумя белыми волнообразными (с семью гребнями) полосами олицетворяет собой две реки, протекающие по границам района - внизу широкая полоса (Амур), вверху узкая полоса (Зея ). В центре флага - ярко зеленая полоса размером 2/8 ширины флага олицетворяет собой лесную растительность, которой покрыта большая часть территории района, а так же сельскохозяйственную направленность района. У древка флага расположен равнобедренный треугольник желтого цвета, имеющий основание равное ширине флага и высоту равную 1/3 ширины флага. Он олицетворяет амурское казачество (войсковой цвет которого был желтым), которое первым заселило и освоило земли современного Свободненского района".

Решением районного Совета народных депутатов от 29 декабря 2009 г №39 (принято райсоветом 28.12.2009 г.) существующая эмблема района была признана его гербом, а описание флага упрощено:

"Флаг района представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Свободненского района в зеленом, синем, желтом и белом цветах".

Флаг района внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 5899.

Материалы геральдического архива В.Маркова.