Флаг Троснянского района утвержден Постановлением Совета народных депутатов Троснянского района от 25 ноября 2010 года №317 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №6519. Описание флага согласно Положению о флаге:

"Полотнище красного цвета с отношением ширины к длине 2:3, несущее посередине фигуры герба - сноп за которым скрещенные мечами, по сторонам дубовые листья и вверху три пчелы, воспроизведенные желтым, белым, серым и оранжевым цветами".

Обоснование символики флага Троснянского района.
Сноп - символ сельскохозяйственной направленности района. Сноп - символ единства, силы, будущего. 8 видимых в снопе колосков - символ 8-ми сельских поселений составляющих единый район.
Перекрещенные мечи и красное поле - символ ратной славы. В начале июля 1943 года на Соборовском поле, что на границе Курской и Орловской областей состоялся крупнейший бой в истории Курско-Орловской битвы Великой Отечественной Войны - с обеих сторон в нем участвовало до полумиллиона человек.
Дубовые листья - символизируют многочисленные дубравы района. Символика дуба многозначна. Дуб - символ стойкости, крепости, долговечности, твердости в вере, защиты.
Пчелы - символизируют трудолюбие жителей района, их сплоченность и взаимовыручку.
Три пчелы, три листика дуба не случайны на гербе района. Символика числа "три" многозначна:
- символ Троицы, триединства;
- символ совершенства (включает нечетное и четное число, 1+2);
- символ законченности: оно имеет начало, середину и конец;
Красный цвет - символ мужества, жизнеутверждающей силы, труда, красоты и праздника.
Серебро - символ чистоты, совершенства, божественной мудрости, благородства, мира.
Золото - символ богатства, урожая, прочности, интеллекта.
Авторская группа:
идея флага: Владимир Миронов (Троснянский район), Константин Моченов (Химки);
художник и компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва);
обоснование символики: Вячеслав Мишин (Химки).

Использованы материалы сайта Союза геральдистов России

Решением Троснянского районного Совета народных депутатов от 21 июля 2011 года №53 в Постановление от 25.11.2010 г. внесено изменение, не коснувшееся описания и внешнего вида флага.