Флаг сельского поселения Верхнекубанское утверждён Решением Совета муниципального образования Верхнекубанское сельское поселение от 5 декабря 2007 года № 219. Описание флага:

"Зелёное полотнище с соотношением сторон 2:3, несущее вдоль нижнего края жёлтую полосу в 1/3 полотнища, а посередине основной части — жёлтое стилизованное изображение виноградной грозди с двумя листами".

Обоснование символики
Флаг языком символов и аллегорий отражает исторические, культурные и экономические особенности сельского поселения.
Зелёный цвет символизирует природу, сельское хозяйство — животноводство, плодородие, жизнь, возрождение, здоровье.
Изображение винограда символизирует плодородие, изобилие, богатство, радость и веселье. Виноград также аллегорически указывает на то, что в поселении выращивают виноград, из коего изготавливают вино и коньяк.
Изображение пшеничных колосьев в оконечности символизирует плодородие, достаток.
Жёлтый цвет (золото) — символ величия, богатства, процветания и прочности, достатка.

Материалы предоставлены "Вексиллографии" А.Данильченко (г.Майкоп)

Флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 3804.