Флаг города Волчанска утверждён Решением Волчанской городской Думы №62 от 25 ноября 2004 года. Описание флага:

"Полотнище с соотношением сторон 2:3, составленное из двух частей: синей и красной, разделенных косой белой полосой с шириной в 1/10 высоты полотнища; верхняя граница полосы проходит от нижнего угла полотнища у древка к границе верхней и средней трети свободного края; ниже этой полосы, параллельно ей, идет вторая белая полоса с шириной в 1/20 высоты полотнища и на таком же расстоянии от первой. В большей синей части помещено изображение фигур городского герба (бурундук и звезды), выполненные желтым, черным и белым цветами. Оборотная сторона зеркально воспроизводит лицевую".

Флаг внесён в Государственный геральдический регистр под №1691

Бурундук - знак богатства природы и недр, а его цвет указывает на месторождения золота. Ступенчато изломанная оконечность представляет собой разрез стенки карьера и показывает, что добыча угля производится открытым способом. Две серебряные изломанные полосы - реки большая и малая Волчанка, давшие название городу. Красный цвет оконечности указывает на то, добываемые угли - бурые. Три разного размера звезды - составляющие город населенные пункты.

Материалы любезно предоставлены А.Грефенштейном

Официально правопреемство герба и флага МО "город Волчанск" передано Волчанскому городскому округу Решением от 23 августа 2012 года. Тогда же утверждены новые Положения о гербе и флаге.