Ямальский район образован в 1930 году. Тундровый посёлок Яр-Сале - с 1934 года центр Ямальского района. В 1996 году на территории района создано муниципальное образование. Ныне в составе Ямальского района существуют сельские поселения: Мыс-Каменское, село панаевск, село Салемал, село Сеяха, село Новый Порт, Яр-Салинское.

На флаге района на белом фоне изображена голова северного оленя, по нижней кромке края стилизованное изображение моря в виде синих волн и рыб. Автор флага - Константин Моченов (г.Химки)

Изображение флага предоставлено М.В.Ревнивцеву начальником отдела информатизации Администрации г.Салехарда И.В.Мельниковым.