Флаг района утвержден Решением Собрания депутатов Жарковского района № 16 от 30 марта 2001 года и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 714. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с соотношением сторон 2:3, разделенное на три горизонтальные полосы - зеленую, белую и голубую. На зеленой полосе воспроизведено золотистое изображение совы из районного герба, на голубой полосе - пять цветков из районного герба".

Белая горизонтальная полоса символизирует реку Межу. Авторы флага: В.Лавренов и К.Моченов.

Материалы взяты с сайта "Регионального геральдического центра"