Флаг Балаклейского района утвержден Решением VII сессии XXIV созыва Балаклейского районного совета от 21 февраля 2003. Согласно тексту Положения о флаге:

"2. Флаг района представляет собой прямоугольное полотнище (отношение ширины к длине 1:2) малинового цвета с изображением синей ленты, пересекающий прямоугольник по диагонали (ширина ленты 1 / 3 от ширины флага). Флаг района двусторонний. Навершии древка представляет собой металлический конус высотой, равной 1 / 10 ширины флага, основа конуса равна двум диаметрам древка, закрепляется на цилиндрической основе высотой, равной 1 / 20 ширины флага. Цвет металла, из которого изготавливается навершие, серебряный.