Флаг Чернухинского района утвержден сессией районного совета 27 августа 2003 года.

"Флаг Чернухинского района имеет отношение сторон 2: 3.
В композицию флага внесено изображение казачьего креста, полумесяца и звезды - традиционных знаков для казачьей геральдики ХVI-XXVII вв. Казачий крест, полумесяц, звезда - символы вечности, духовности, святости, основные символы флага Чернухинского района.
Золотой лапчатый крест в синем фоне является знаком флага Полтавской области и подчеркивает административное подчинение района.
Раздвоенный крест на подножии - древний символ Чернух, который в XVIII в. использовала и Чернухинская сотенная канцелярия.
Шестиконечная звезда, полумесяц - древние казачьи символы означают победу христианства над магометанством.
Малиновый цвет подчеркивает казачью традицию.
Черный цвет символизирует местные черноземы, ассоциативно указывает на название поселка.
Голубой, желтый - это цвета национального флага Украины".

Использованы материалы сайты общины Чернухи