Город Нарва-Йыэсуу получил городской статус в 1993 году (до этого считался частью Нарвы). Видимо тогда же он стал самоуправляемым городом В 2017 году к городу Нарва-Йыэсуу присоединена бывш. Вайвараская волость.

Флаг города утвержден 8 марта 1994 года. Полотнище флага вертикально разделено на синее и жёлтое поля. На синем поле у древка изображено желтое солнце, а в центре желтого поля проходит синяя горизонтальная полоса (одна треть ширины флага). Стандартный размер флага — 105 х 165 см. Композиция флага города Нарва-Йыэсуу символизируют историческую и географическую связь города с городом Нарва и его расположение в устье реки Нарва; а также репутацию Нарва-Йыэсуу как летнего и оздоровительного курорта.

Материалы вексиллологического архива А.Басова

В 2017 году этот же флаг сохранен для укрупненного муниципалитета Нарва-Йыэсуу.

Упразднённые муниципалитеты, вошедшие в состав города Нарва-Йыэсуу:

волость Вайвара (Vaivara vald)

Вайвараская волость создана в 1992 году. Центром волости был посёлок Синимяэ. В ходе муниципальных преобразований в 2017 году Вайвараская волость вошла в состав городского муниципалитета Нарва-Йыэсуу.

По данным сайта Правительства Эстонии герб и флаг волости Вайвара утверждены 19 февраля 1993 года, автор - Тийна Рандоя (Tiina Randoja). В центре герба и флага изображена одна из археологических находок на территории края. Стандартный размер флага — 96 x 160 см. Синий цвет символизирует море, небо и надежду на то, что муниципалитет Вайвара станет сильным, процветающим и безопасным домом для своих жителей. Фибула (археологическая находка IV века, обнаруженная в Тюрсамяэ (волость Вайвара) символизирует защиту и выносливость, преемственность и единство.

По материалам геральдического архива В.Басова (г.Минск). А также - символика волости Вайвара