Флаг волости утвержден 23 ноября 1998 года.

Источник - сообщения А.Басова

В 2017 году территория Пейпсияяреской волости расширена путем присоединения земель волостей Алатскиви, Пала, Вара и города Калласте.

18 апреля 2018 года волостной совет утвердил новые символы Пейпсияяреской волости. Автор герба и флага - Марью Поттисеп. На жёлтом полотнище флага изображен портал замка Алатскиви, у древка синяя волнистая полоса. Выбору символики предшествовал конкурс и общественное голосование за лучший проект.

Источник - http://www.peipsivald.ee/sumboolika