Богатовский район Средневолжского края образован в 1935 году. Центр - село Богатое. В 2004 году Богатовский наделен статусом муниципального района. В его составе созданы муниципальные образования 1-го уровня - сельские поселения.

Флаг Богатовского района утвержден постановлением собрания представителей от 23 июня 2004 года № 29. Описание флага:

"Прямоугольное двустороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3.
Поле флага разделено - нижняя треть (зеленый) и 2 верхних трети (голубой или лазоревый).
Фигура в верхней левой части поля - золотое соцветие подсолнечника с червлеными лепестками внутри и черными зернами.
Символика сведена к ведущей отраслям хозяйства (сельское хозяйство).
Флаг разработан на базе герба муниципального района Богатовский".

По материалам сайта "РИА-Самара", по сообщению В.Попоски

Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 1818.