Флаг Богдановского СП утвержден решением Собрания депутатов Богдановского СП от 23 января 2023 года № 60 и внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 14 192. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба Богдановского сельского поселения в красном, черном, желтом, белом и зеленом цветах".

Орел – символ силы, фреза обозначает добучу камня-песчаника, 16 колосьев – 16 населенных пунктов в поселении.

Материалы геральдического архива В. Маркова