Спас-Клепиковский район впервые образован в 1919 году, но вскоре преобразован в уезд. В 1929 году вновь образован Клепиковский район в составе Рязанского округа Московской области. С 1937 года - в Рязанской области. В 1963-65 гг. район временно упразднялся. В 2004 году муниципальное образование Клепиковский район получило статус муниципального района. В его составе созданы Спас-Клепиковское и Тумское городские поселения и несколько сельских поселений: Алексеевское, Болоньское, Бусаевское, Екшурское, Колесниковское, Криушинское, Молькинское, Ненашкинское, Оськинское, Уткинское. Областным законом от 5 мая 2025 года Клепиковский муниципальный район был преобразован в Клепиковский муниципальный округ.

Флаг Клепиковского района утвержден Решением Совета депутатов муниципального образования — Клепиковский муниципальный район от 28 ноября 2013 года № 98 "Об утверждении положения о флаге муниципального образования — Клепиковский муниципальный район Рязанской области". Автор флага - М.К.Шелковенко. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №8858. Описание флага согласно тексту Положения о флаге:

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух равновеликих вертикальных полос зелёного (у древка) и синего цвета, несущее композицию фигур из герба муниципального района — жёлтого, посередине, двойного (патриаршего) креста с пятью верхними трилистными концами и расширяющимся нижним концом, соединённым с такой же, дважды вогнутой, полосой вдоль нижнего края полотнища, общей шириной в 1/6 ширины полотнища, с зелёной княжеской шапкой в центре, имеющей чёрную опушку и жёлтое над ней украшение („городок“) с красным самоцветом, сопровождённые у древка белым лосиным рогом, а у свободного края — белой с красными плавниками и хвостом всплывающей к кресту рыбой".

Источник рисунка - "ВИКИПЕДИЯ" (авт. сообщ. - В.Пермяков). Текст решения - из базы нормативных документов Минюста.

После преобразования района в Клепиковский муниципальный округ символы переутверждены Решением Думы Клепиковского муниципального округа от 11 ноября 2025 года № 36. Описание флага не изменилось (даже слово "район" не заменено на "округ"...)

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух равновеликих вертикальных полос зелёного (у древка) и синего цвета, несущее композицию фигур из герба муниципального района — жёлтого, посередине, двойного (патриаршего) креста с пятью верхними трилистными концами и расширяющимся нижним концом, соединённым с такой же, дважды вогнутой, полосой вдоль нижнего края полотнища, общей шириной в 1/6 ширины полотнища, с зелёной княжеской шапкой в центре, имеющей чёрную опушку и жёлтое над ней украшение („городок“) с красным самоцветом, сопровождённые у древка белым лосиным рогом, а у свободного края — белой с красными плавниками и хвостом всплывающей к кресту рыбой".

Материалы геральдического архива В.Маркова