Флаг Курчатова утверждён Решением Курчатовской городской Думы от 29 мая 2013 года №39.

"Флаг города Курчатова представляет собой прямоугольное полотнище, разделенное вертикальной линией на две равные части, представляющие собой два квадрата. Левый, ближний к древку, квадрат имеет белый цвет. Правый квадрат лазурного цвета. В центре флага расположена стилизованная эмблема атома, которая окрашивается в цвет золота. Отношение высоты флага к его длине - 1:2, диаметр эмблемы атома составляет 2/3 высоты флага.
Обоснование символики флага города.
Квадрат лазурного цвета символизирует водную поверхность пруда-охладителя энергоблоков Курской АЭС - "Курчатовского моря". Ближний к древку белый квадрат символизирует часть суши, занимаемую городом. Квадрат - символ надежности, устойчивости. Белый цвет - символ чистоты, надежды, правдивости, благородства, откровенности (искренности). Эмблема атома - символ города атомщиков и градообразующего предприятия города - Курской АЭС. Цвет золота символизирует могущество, знатность, постоянство, богатство".

В тексте использованы материалы Официального сервера органов власти Курской области, а также сообщений В. Пермякова