В 2004 году муниципальное образование в границах района получило статус муниципального района. Законом Курской области от 03.04.2026 г. Медвенский муниципальный район упразднён, взамен него создан Медвенский муниципальный округ.

Флаг Медвенского района утвержден Решением Представительного Собрания муниципального района Медвенский район» от 23 декабря 2019 года № 15/108. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 12718. Описание флага:

«Прямоугольное двухстороннее полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее фигуры из герба Медвенского района, выполненные зеленым, черным, жёлтым и белым цветом. Обратная сторона полотнища зеркально воспроизводит лицевую».

Обоснование символики:
Флаг Медвенского района составлен на основании герба Медвенского района и повторяет его символику.
Название Медведского района происходит от названия его административного центра – поселка городского типа Медвенка, датой основания которого, основываясь на архивных документах, краеведы ставят середину XVII века. Дата создания Медвенского района с уточнением его границ относится к концу 20-х начала 30 годов XX века. Район расположен в центральной части Курской области, его территория составляет 1.08 тысяч кв.км. На территории Медвенского района находится один из крупнейших участков Центрально-Черноземного государственного природного биосферного заповедника им. профессора В. В. Алехина («Казацкая Степь»). Заповедник был организован в 1935 году для сохранения эталонных целинных черноземов и последних участков девственных степей с богатейшим видовым разнообразием травянистой растительности. В 1979 году по инициативе ЮНЕСКО он был включён в мировую сеть биосферных резерватов. С 1995 года заповедник является полноправным членом Федерации национальных парков и природных резерватов Европы. В 1998 году он стал одним из четырёх заповедников России, награжденных Дипломом Совета Европы.
Символика косули многозначна:
- это символ стремления жителей района сохранить и приумножить животный и растительный мир, благодаря чему «Казацкая степь» сохранилась в первозданном виде и стала важной частью заповедника. Обращенная косуля – символ особо охраняемой территории заповедника;
- косуля, как традиционный символ красоты и грации, которые всегда вдохновляют творческих людей, символизирует Медвенский район, как родину выдающихся русских деятелей культуры и искусства (писатель Константин Дмитриевич Воробьёв, художник, заслуженный деятель искусств РСФСР Ефим Михайловичем Чепцов, чьи полотна находятся в Третьяковской галерее);
- косуля – символ бережного отношения к родной земле местных жителей, что нашло отражение в создании Медвенского краеведческого музея им. Д. Я. Самоквасова, насчитывающем более трех тысяч экспонатов, заботливо собираемых для изучения истории культуры, традиций и быта.
Ковыль – символ степи, степного раздолья, который одновременно символизируют простор и широту души жителей Медвенского района. Вместе с тем, ковыль перекликается с фигурой растения на эмблеме Центрально-Черноземного заповедника им. профессора В. В. Алехина, тем самым подчеркивая исторически сложившуюся общность территории заповедника и района. Нижняя часть флага, составленная из чередующихся желтых и черных клиньев – аллегория распаханного поля, символизирует сельское хозяйство, как основной вид деятельности района. Черные клинообразные полосы символизируют распространенные на территории Медвенского района уникальные чернозёмы – один из предметов гордости, охраны и изучения сотрудниками Центрально-Черноземного заповедника им. профессора В. В. Алехина. Ныне крайне редки типичные чернозёмы, никогда не подвергавшиеся вспашке. Их нередко используют в качестве эталонов при изучении влияния на почвы современного сельского хозяйства.
Таким образом, во флаге Медвенского района языком геральдических символов и аллегорий гармонично отражены его природные, культурные особенности и основной вид деятельности местного населения.
Применённые во флаге цвета символизируют:
желтый цвет (золото) – символ высшей ценности, величия, богатства, урожая;
белый цвет (серебро) – символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения;
черный цвет – символ плодородия, мудрости, скромности, вечности бытия;
зеленый цвет символизирует природу, весну, здоровье, молодость и надежду.

Авторская группа:
идея флага: Николай Зюзин, Алексей Краснопивцев, Виктор Конорев (все - пгт Медвенка), Константин Моченов (Химки);
художник и компьютерный дизайн: Анна Гарсия (Москва);
обоснование символики: Ольга Френкель (Москва).

По материалам сайта Союза геральдистов России