Нефтекумский район образован в 1920 году. В 1963-65 гг. временно создавался Нефтекумский промышленный район. В 2004 году муниципальное образование в границах района получило статус муниципального района. В его составе были образованы муниципальные образования 1-го уровня: городские поселения "город Нефтекумск" и "посёлок Затеречный"; сельские поселения: Закумский сельсовет, Зимнеставочный сельсовет, Зункарский сельсовет, Кара-Тюбинский сельсовет, Каясулинский сельсовет, Махмуд-Мектебский сельсовет, Новкус-Артезианский сельсовет, Озек-Суатский сельсовет, село Ачикулак, Тукуй-Мектебский сельсовет. В соответствии с Законом Ставропольского края от 29 апреля 2016 года № 47-кз все муниципальные образования Нефтекумского муниципального района преобразованы в новое единое МО - Нефтекумский городской округ. Закон Ставропольского края от 30 мая 2023 года преобразовал Нефтекумский городской округ в Нефтекумский муниципальный округ.
Cовет Нефтекумского муниципального района своим Решением №63 от 25 октября 2005 года утвердил "Положение о символике Нефтекумского муниципального района Ставропольского края". Согласно тексту Положения:
"Статья 9. Флаг Нефтекумского муниципального района представляет собой прямоугольное полотнище. В рассеченном золото-зеленом поле флага под лазоревой волнообразной о двух волнах главой, обремененной двенадцатью золотыми колосьями в столб черная фонтанирующая нефтяная вышка. Отношение ширины флага к его длине 2:3".
Использованы материалы сайта Нефтекумского района
Решением Совета Нефтекумского МР от 27 декабря 2005 года № 95 в Положение о символике (25.10.2005 г.) внесены некоторые технические правки.
По материалам книги Н.Охонько данный флаг не был одобрен Геральдическим советом при президенте РФ. Было рекомендовано переработать флаг.
21 марта 2006 года решением Совета Нефтекумского района №119 утверждён флаг Нефтекумского района.
2. Описание и обоснование символики флага района
2.1. Описание флага района:
Флаг района представляет собой прямоугольное полотнище. Золотое поле, под лазоревой волнообразной о двух волнах главе две противообращенных золотых головки пшеничного колоса в пояс, усеяно черными каплями. Отношение ширины флага к его длине 2:3.
2.2. Обоснование символики флага района:
Лазоревая волнообразная глава и золотое поле флага, усеянное черными каплями, развивают тематику, заложенную в названии района «Нефтекумский».
Волнообразная глава символизирует водный бассейн района, в числе которого и река с именем «Кума», присутствующим в сложносоставном слове «Нефтекумский».
Традиционный геральдический символ влаги, жидкости и нефти в том числе «слеза» (капля) черного цвета призвана символизировать наличие нефти в недрах района и первую части сложносоставного слова «Нефтекумский».
Золотые колосья и выше помянутая «слеза» (капля) отражают административно-хозяйственную аграрно-промышленную ориентацию района.
В 2008 году флаг Нефтекумского района внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 3890.
Решением Совета Нефтекумского МР от 11 декабря 2009 года №191 внесены изменения в Решение от 25.1.2005 г. "О Положении о символике Нефтекумского МР..": удалены абзацы, содержащие описания символов.
Флаг города Нефтекумска утверждён решением Совета депутатов города 26 декабря 2001 года. Полотнище разделено на четыре поля - два голубых и два жёлтых. В центре изображение герба города. Синий и жёлтый цвета символизируют Европу и Азию, на границе которых расположен Нефтекумск.
По материалам книги Н.А.Охонько "Символы малой родины" и базы нормативных документов Минюста