Описание флага города Рыбинска (а точнее Рыбинского муниципального округа) утверждено решением Рыбинского Совета депутатов № 92 от 17 июля 2001 года. Решение подписал Председатель Рыбинского Совета депутатов В.В.Пахарев. Согласно Положению о флаге (Приложение 1 к Решению №92):

"1.3. Флаг Рыбинского муниципального округа Ярославской области представляет собой прямоугольное червленное полотнище с отношением ширины к длине 2:3. Полотнище в масштабе 1:3 по горизонтали разделено поясом лазоревого цвета, символизирующим реку, над которым - зеленый берег с золотой пристанью, из-за которой выходит черный восстающий медведь, держащий в левой лапе на левом плече золотую секиру; золотые двойные мостки простираются поверх пояса; ниже мостков пояс обременен двумя сообращенными белыми стерлядями".

Официальное описание флага (Приложение 3 к Решению №92):

"Флаг Рыбинского муниципального округа Ярославской области представляет собой прямоугольное червленное полотнище с отношением ширины к длине 2:3. Полотнище в масштабе 1:3 по горизонтали разделено поясом лазоревого цвета, символизирующим реку, над которым - зеленый берег с золотой пристанью, из-за которой выходит черный восстающий медведь, держащий в левой лапе на левом плече золотую секиру; золотые двойные мостки простираются поверх пояса; ниже мостков пояс обременен двумя сообращенными белыми стерлядями. Габаритная ширина элементов герба на флаге Рыбинского муниципального округа должна составлять 2/5 части длины полотнища флага".

2 августа 2001 года флаг города Рыбинска был несколько изменён. Новая версия флага - жёлтое полотнище с гербом в центре - впервые поднята 4 августа 2001 года.

В тексте использованы материалы городского сайта Рыбинска и материалы Аналитического центра Администрации Ярославской области

В 2002 году флаг Рыбинского муниц. округа внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 982.

Рыбинский муниципальный округ прекратил существование 1 июля 2006 года. Символы округа перешли к Рыбинскому городскому округу. Для Рыбинского муниципального района разработаны новые символы.

Флаг бывшего Рыбинского муниципального округа утверждён в качестве герба городского округа Рыбинск Решением муниципального Совета городского округа Рыбинск № 52 от 22 июня 2006 года.

"Прямоугольное червленое полотнище с соотношением ширины к длине 2:3. Полотнище в масштабе 1:3 по горизонтали разделено поясом лазоревого цвета, символизирующем реку, которым - зеленый берег с золотой пристанью, из-за которой выходит восстающий медведь, держащий в левой лапе на левом плече золотую секиру; золотые двойные мостки простираются поверх пояса; ниже мостков пояс обременен двумя сообращенными серебристыми стерлядями.Габаритная ширина элементов герба на флаге города Рыбинска должна составлять 2/5 части длины полотнища флага.