Сампурский район образован в 1928 году. Центром района до 1979 года было село Сампур, затем - посёлок Сатинка. До 2023 года существовало муниципальное образование Сампурский район. В мае 2023 года МО "Сампурский район" преобразовано в Сампурский муниципальный округ, при этом все поселения в составе района утратили муниципальный статус.

Флаг Сампурского района утверждён Решением Сампурского районного Совета народных депутатов от 22 декабря 2016 года № 248 "Об утверждении Положения о гербе и флаге Сампурского района Тамбовской области". Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 11288.

9.1. Флаг района представляет собой зелёное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, на всю поверхность которого распространена композиция из герба района с заменой геральдического золота - желтым, а геральдического серебра - белым цветом. Оборотная сторона флага является зеркальным отображением его лицевой стороны.

По сообщению В. Маркова со ссылкой на Тамбовский областной портал

В мае 2023 года МО "Сампурский район" преобразовано в Сампурский муниципальный округ.

Решением Совета депутатов Сампурского муниципального округа от 25 января 2024 года № 95 утверждено Положение о гербе и флаге Сампурского муниципального округа. Флагом округа стал уже существующий флаг Сампурского района.

По информации В. Маркова