Верхнеуральск в прошлом центр уезда. Верхнеуральский район создан в 1926 году. С 2004 года муниципальное образование именовалось Верхнеуральский муниципальный район, в том же году в составе муниципального района созданы городские и сельские поселения, в т.ч. и "Верхнеуральское городское поселение". В марте 2025 года Верхнеуральский муниципальный район преобразован в Верхнеуральский муниципальный округ, Верхнеуральское городское поселение упразднено.

Флаг Верхнеуральского района разработан авторской группой: Константин Мочёнов, Галина Туник (обоснование символики), Сергей Исаев (компьютерный дизайн). Флаг утвержден Постановлением №138 районного Совета депутатов от 6 марта 2003 года. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, разделённое по горизонтали на две неравные полосы: верхнюю зелёную в 2/3 ширины полотнища и нижнюю жёлтую в 1/3 ширины полотнища, несущее в центре фигуру из герба района: горностая, изображённого геральдическим горностаевым мехом с противогорностаевым кончиком хвоста".

Флаг внесён в Государственный геральдический регистр под №1172.

Использованы материалы книги К.Ф.Моченова и Г.А.Туник "Официальные символы Челябинской области и муниципальных образований"
с любезного разрешения К.Ф.Моченова