Флаг Высоково утверждён Решением Совета депутатов сельского поселения Высоково от 17 февраля 2012 года № 08 "Об утверждении Положения о гербе и флаге муниципального образования сельское поселение Высоково Рамешковского района Тверской области" и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 7523.

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее композицию герба в белом, зеленом и красном цветах".

"Толкование ГЕРБА и ФЛАГА:
«Говорящий герб. Композиция герба отражает название поселения - Высоково,что говорит о высоком месте, возвышении, некоей высоте, что в геральдике изображается холмом. Крест символизирует Преображенский Собор в с. Замытье и комплекс Спасского женского монастыря в д.Пальцево.
Княжеская корона в холме-отражает то, что земли поселения были пограничными между Тверским княжеством и Новгородской республикой. Значительная часть земель поселения принадлежала князьям Голицыным.
Зелёный цвет – есть символ красоты природы, богатства и изобилия. Серебро – символ чистоты, красоты и благородства».

Материалы геральдического архива В. Маркова.