До 2022 года существовало муниципальное образвание "городское поселение город Зубцов" (Зубцовского муниципального района). В 2022 году при преобразовании Зубцовского района в муниципальный округ МО городское поселение "город Зубцов" упразднено.

Флаг города Зубцов утвержден Решением Совета депутатов МО "город Зубцов" от 20 августа 2008 года № 143. Согласно тексту Положения о флаге:

3. Описание и обоснование символики флага
3.1. Описание флага города Зубцова: «Прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, состоящее из трех полос: белого, голубого и светло-зеленого цветов . В центре, вверху полосы белого цвета занимающей 2/3 полотнища флага, - герб Зубцова объемом 1/5 части полотнища, остальные части полотнища долями по горизонтали - голубой и светло-голубой цвета
3.2. Обоснование символики флага: Флаг в целом символизирует расположение города с окружением водной территорией рек Волга, Вазуза , Вазузского водохранилища и лесов -зеленой зоны .
По верху голубой полосы флага - волнистая линия, символизирующая водную поверхность, светло-зеленая полоса - зеленую зону Зубцова.
3.3. Авторская группа:
идея флага: Шадынин М.И. Подвойский Н П.. художник: Макарцев А.В. компьютерный дизайн: Подвойский Н.П.

По материалам базы нормативных документов Министерства юстиции.

В сентябре 2008 года гербовый флаг Зубцова внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №2347. При этом ссылались на решение № 143 от 20.08.2008 г. (исправлено задним числом ?)

Данные от В. Маркова

Видимо, флаг 2008 года не был одобрен Геральдическим советом. Решением Совета депутатов МО "город Зубцов" от 2 февраля 2009 года № 34 утвержден другой флаг Зубцова - "Прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух полос, повторяющих рисунок муниципального герба".

По материалам сайта А.Ушакова и компании "ТУШ" и базы нормативных документов Министерства юстиции.