Село Бортники входит в Фастовскую городскую общину Фастовского района. До муниципальной реформы было центром сельсовета в том же районе.

Флаг села Бортники утвержден решением Бортниковского сельского совета от 18 июля 2003 года. Полотнище состоит из равных вертикальных полос - зеленой и синей. На зеленом фоне изображена пчела и орнамент из сот. Синий цвет символизирует мир и волю, зеленый - достаток.

По материалам буклета "Символика Фастовского района (к 85-летию Фастовщины)".