Флаг Козелецкого района утвержден 29 августа 2008 года. Автор - А. Гречило. Полотнище состоит из четырех вертикальных полос (соотношение ширины 1:2:1:2), в центре жёлтый цветок козельца. Пропорции полотнища - 2:3.

Синие полосы символизируют реки Днепр и Десну. Малиновые - казачье прошлое. Цветок козельца - "говорящий" символ.

Материалы статьи А. Гречило в бюллетене "Знак" № 54 (2011 г.). Цветной рисунок взят с сайта Черниговской областной Рады

Утверждены также штандарты главы Козелецкого районного совета и главы районной госадминистрации. Это квадратное полотнище (малиновое у главы районного совета, тёмно-синее у главый райгосадминистрации) полотнище с изображением большого герба района.

По материалам рубрики Р.Гаврилюк "Геральдика Козельца и Козелецкого района" на сайте "Козелец-LIFE"; а также статьи А. Гречило в бюллетене "Знак" № 54 (2011 г.).