В соответствии с Законом Ставропольского края от 14 апреля 2017 года № 34-кз все муниципальные образования Новоалександровского муниципального района были преобразованы в новое МО - "Новоалександровский городской округ".

Флаг Новоалександровского района утвержден Решением Совета Новоалександровского муниципального района от 21 сентября 2007 года №28/15. Cогласно тексту Положения о флаге:

"3. Описание и обоснование символики флага Новоалександровского муниципального района
3.1. Описание флага Новоалександровского муниципального района:
"Флаг Новоалександровского муниципального района представляет собой горизонтальное дважды рассеченное красно-желто-красное полотнище с соотношением сторон 2 : 3, несущее в себе фигуры герба: обращенную к древку острием вверх казачью шашку в столб в синих ножнах с белыми обоймами и красной рукоятью, два желтых снопа пшеницы о шести головок колоса в каждом».
3.2. Обоснование символики флага Новоалександровского муниципального района.
Флаг Новоалександровского муниципального района разработан на основе герба и воспроизводит фигуры гербовой композиции, отражающие исторические особенности района. Новоалександровский район Ставропольского края, центром которого является город Новоалексанрдровск (бывшее селение Александровское, позднее переименованное в станицу Новоалександровскую) – «гласный» или «говорящий», поскольку красный цвет поля щита – цвет легендарного античного полководца Александра Македонского.
Желтый цвет и два снопа пшеницы того же цвета призваны символизировать то, что Новоалександровский района в аграрном Ставропольском крае лидер по урожайности зерна, а до вхождения в 1944 году в состав Ставропольского края Новоалександровский район административно находился в Краснодарском крае, который считается житницей России. Снопы пшеницы числом головок колоса 6+6 символизируют 12 муниципальных образований поселений, входящих в состав муниципального района. Это число ассоциируется с 12-ю учениками Христа, вера в которого служит фундаментом казачьей духовности.
Казачья шашка, вложенная в ножны – легендарное казачье прошлое района, а также олицетворение возрожденного в наши дни казачества. Она отвечает старинной казачьей поговорке: «Без нужды не вынимай, без славы не вкладывай» Вложенная в ножны шашка говорит о славных подвигах новоалександровских казаков, стоявших на Кубанской линии.
Красный цвет рукояти шашки – цвет Кубанского казачьего войска, в состав которого новоалександровские казаки входили в прошлом. Синий цвет ножен символизирует Терское казачье войско, в состав которого новоалександровское казачество входит сегодня. Белый цвет обоймы ножен – цвет серебряного казачьего прибора.
Красный цвет - символ мужества, жизнеутверждающей силы и красоты, праздника.
Желтый цвет - символ высшей ценности, величия, великодушия, богатства, урожая.
Голубой цвет - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения.
Белый цвет - символ открытости, совершенства, благородства, взаимопонимания".

По сообщению В.Маркова (г.Санкт-Петербург)

Флаг района внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 3898.