Черлакский район образован в 1929 году. До 2025 года муниципальное образование именовалось "Черлакский муниципальный район". Областным законом от 5 июня 2025 года муниципальный район преобразован в муниципальный округ "Черлакский район". Административный центр — рабочий посёлок Черлак.

Флаг МО "Черлакский муниципальный район" Омской области утверждён Решением Совета Черлакского муниципального района от 16 сентября 2011 года № 60 "Об утверждении Положения "О Флаге Черлакского муниципального района Омской области". Описание флага:

"Флаг представляет собой прямоугольное полотнище с соотношением ширины к длине 2:3 разделённое по горизонтали на две неравные полосы: верхняя белого цвета в 2:3 ширины полотнища и нижняя красного цвета, в 1:3 ширины полотнища. Параллельно древку, на расстоянии 3:7 длины от древка расположена синяя волнистая полоса по всей ширине полотнища, шириной 1:8 длины".

Символика флага: белый цвет флага символизирует чистые помыслы, мир и взаимопонимание, красный цвет символизирует труд, мужество, праздник, красоту, синяя волнистая полоса символизирует природную особенность района — реку Иртыш.

По материалам "ВИКИПЕДИИ" (автор сообщения В. Пермяков). 2012 г. Текст документа также прислан В. Пермяковым.

Флаг Черлакского района утвержден Решением Совета Черлакского муниципального района № 30 от 20 марта 2020 года. Флаг внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 13198.

"2. Описание и обоснование символики флага
2.1. Описание флага Черлакского муниципального района:
Флаг Черлакского муниципального района основан на гербе Черлакского муниципального района и представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух горизонтальных полос – красной и зелёной, разделённых белой узкой полосой, ограниченной волнистыми линиями (ширина узкой полосы без учёта волн 1\10 ширины полотнища, волны суммарно выступают на 1\4 от ширины полосы); в центре полотнища поверх всех полос сторожевая башня с треугольной крышей, с открытым проходом, со стенами по бокам (её пропорции немногим больше 1\2 ширины и 1\3 длины полотна, нижний край башни и стен расположен выше от нижнего края полотна на 1\4 ширины полотна), ниже башни на зелёном фоне жёлтые колосья положенные косо накрест, над башней на красном фоне три белых летящих чайки с поднятыми крыльями, боковые чайки не выше верхней точки крыши, равноудалены от боковых краёв, место занимаемое чайками равно 1\2 длины полотна (приложение №1 и приложение № 2).
2.2. Обоснование символики флага Черлакского муниципального района:
Флаг Черлакского муниципального района разработан на основе символики герба Черлакского муниципального района
2.3. Авторская группа: идея флага – Новиков В.С. (Кандидат исторических наук), доработка – Груздов Е.В., художник – Журавлёв Е. Н. (члены Сибирской геральдической коллегии).

По информации В. Пермякова