До 2019 года пгт. Яя был центром муниципального образования "Яйское городское поселение". В 2019 году с преобразованием Яйского муниципального района в Яйский муниципальный округ все городские и сельские поселения в его составе утратили муниципальный статус.

Флаг муниципального образования "Яйское городское поселение" Яйского района Кемеровской области утверждался Решением Яйского поселкового Совета народных депутатов от 25 октября 2007 №71 "О флаге Яйского городского поселения" и Решением Яйского поселкового Совета народных депутатов от 27 декабря 2007 №101 "О флаге Яйского городского поселения".

"Флаг представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из двух равновеликих горизонтальных полос: жёлтого (вверху) и голубого цвета, в центре которого круг белого цвета диаметром в ? длины полотнища, поверх которого выходящее за его верхний край схематическое изображение ели (в виде трёх треугольников, поставленных один на другой) зелёного цвета".
Символика
Флаг разработан на основе герба Яйского городского поселения, который языком символов и аллегорий отражает природные, экономические и исторические особенности региона.
Фон флага разделён на две цветовые части: верхняя часть - жёлтая, нижняя часть - лазоревая (голубая, синяя).
Жёлтый цвет - символизирует цвет хлебных колосьев, песчаных карьеров расположенных на территории Яйского городского поселения, а также традиционный символ урожая, богатства стабильности, уважения и интеллекта.
Голубой цвет (лазурь) символизирует - реку Яя, на берегах которой был образован одноименный посёлок Яя.
В центре полотнища располагается изображение спила дерева и ели. Ель символизирует лесное богатство посёлка - символ природы, здоровья, жизненного роста. Спил дерева указывает на историческую особенность промышленного производство на территории посёлка Яя - заготовка и сплав леса по реке Яя".

Источник - "Википедия"

Флаг Яйского ГП внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 4000.