Положение о флаге МО город Заозёрный утверждено Решением Заозёрновского городского Совета депутатов от 25 марта 2015 года № 16-62Р "Об утверждении Положения о флаге ..."

3. Описание и обоснование символики Флага города Заозерного
3.1. "Полотнище с соотношением ширины к длине 2:3, составленное тремя горизонтальными полосами голубого, желтого, красного цветов, имеющими ширину 1/3, 1/3 и 1/3 соответственно. По центру желтой полосы помещено изображение герба муниципального образования город Заозерный – «В лазоревом поле, червлёное опрокинутое остриё с вписанным серебряным свободным остриём; поверх всего чёрные лопата и кирка накрест, поверх которых три золотые головки колоса». По центру красной полосы белыми буквами нанесено название муниципального образования. Оборотная сторона полотнища зеркально воспроизводит лицевую сторону".
3.2. Рисунок флага города Заозерного в цветном воспроизведении помещен в Приложении к настоящему Положению.
3.3. Символика флага города Заозерного воспроизводит символику герба муниципального образования. Первые упоминания о поселении охотников эвенков и кыргызов у озёр, на месте будущего города, относятся к середине XVII века. В 1694 году местным населением были обнаружены соляные ключи, и в том же году открыта соляная варница. Основной целью основания посёлка явилась возможность добычи здесь слюды для окон церквей и монастырей, тобольских и московских палат. Во флаге муниципального образования город Заозерный название нашло отражение в голубой полосе в верхней части флага, которая указывает на большое количество водоемов на территории. Голубой цвет в геральдике символизирует цвет ясного неба, символизирует постоянство и преданность, правосудие и совершенство. Красный цвет – символ красоты, мягкости и величия. Желтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения. Белый цвет (серебро) – символ чистоты, совершенства, искренности и взаимопонимания.

По сообщению В.Пермякова. Рисунок - реконструкция "Вексиллографии" по описанию

Вышеуказанный флаг не был внесён в Государственный геральдический регистр РФ.

В 2025 году Заозёрный утратил статус муниципального образования, а также перестал быть административным центром Рыбинского района (центром Рыбинского округа стал город Бородино). Тем не менее внесенный в геральдический регистр РФ герб Заозёрного сохранился как герб населенного пункта, и для населенного пункта город Заозёрный Рыбинского муниципального округа Красноярского края утвержден флаг Решением Рыбинского окружного Совета депутатов Красноярского края от 26.02 2026 № 10-123р. Этот флаг внесён в Государственный геральдический регистр РФ под № 15477. Описание флага:

"Прямоугольное полотнище синего цвета с отношением ширины к длине 2:3, воспроизводящее в середине с фигуры из герба населенного пункта город Заозёрный, выполненную красным, белым, черным и желтым цветами. Обратная сторона полотнища зеркально воспроизводит лицевую".

По информации В. Маркова