Флаг Истринского района утвержден решением Истринской районной Думы №13/5 14 марта 1997 года и внесен в Государственный геральдический регистр под №424.

"Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, с голубым изображением поля флага, на котором на 1/6 от низа белый в 1/6 волнистый пояс, над которым по центру расположено жёлтое о 16 лучах солнце".

Автор флага - Константин Моченов (г.Химки), художник - Роберт Маланичев (г.Москва). Солнце появилось на гербе Истры (тогда Воскресенска) еще в 1781 году и означало "имя сего города".

Использованы материалы книги К.Моченова "Официальные символы Подмосковья", М., 2003, предоставленные В.Марковым

Флаг Истринского муниципального района утвержден решением Совета депутатов Истринского муниципального района от 20 ноября 2008 года №11/6 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №424 (т.е. флаг перерегистрирован взамен флага Истринского района, утвержденного решением Истринской районной Думы от 14.03.1997 г. № 13/5 с сохранением номера регистрации). Описание флага:

"Прямоугольное голубое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, с изображением горизонтальной волнистой белой полосы в 1/6 ширину полотнища отстоящую от нижнего края на 1/6 ширины полотнища, над полосой по середине расположено желтое солнце о шестнадцати лучах".

Обоснование символики флага Истринского муниципального района .
Флаг разработан с учетом композиции герба Истринского муниципального района, который составлен на основе двух исторических гербов: Высочайше утвержденного 20 декабря 1781 года (по старому стилю) уездного города Воскресенска (с 1930 года город Истра), подлинное описание которого гласит: "Въ верхней части щита гербъ Московскiй. Въ нижней - золотое солнце, въ голубомъ пол?, яко принятый всеобщий знакъ, означающiй имя сего города", и герба современного города Истра, утвержденного Советом народных депутатов 17 марта 1989 года. Белая волнистая полоса языком геральдики показывает реку Истру, давшее нынешнее название городу и району.
Использование двух исторических гербов, как основы композиции районного флага символизирует взаимосвязь города и района, территориальную и историческую общность двух муниципальных образований. Символы XVIII и ХХ столетий объединились на флаге района в неразрывную линию истории и современности, направленную в будущее.
Голубой цвет - символ чести благородства, духовности.
Желтый цвет (золото) - символ богатства, урожая, стабильности, уважения, солнечного тепла и света. Солнце - символ мира и благополучия.
Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Авторская группа:
идея флага: Константин Моченов (Химки), Юрий Моченов (Химки);
художник: Роберт Маланичев (Москва);
компьютерный дизайн: Оксана Афанасьева (Москва);
обоснование символики: Кирилл Переходенко (Конаково)".

По материалам сайта "Союза геральдистов России"